Το 2005, ο Γιώργος Ανεμογιάννης, ιδρυτής του Μουσείου και σκηνογράφος, με ιδιόγραφη διαθήκη, κληροδότησε στο Μουσείο και το προσωπικό του Αρχείο. Το αρχείο αυτό περιήλθε στο Ίδρυμα ακέραιο το 2009.
Το Αρχείο Ανεμογιάννη, ένα από τα αρτιότερα οργανωμένα θεατρικά αρχεία της Ελλάδας αλλά και παγκόσμια, περιλαμβάνει:
• θεατρικές μελέτες πεντακοσίων και πλέον παραστάσεων
• ζωγραφικά σχέδια
• τρισδιάστατες μακέτες σκηνικών και κοστουμιών
• δημοσιεύματα Τύπου
• φωτογραφικό υλικό
• αλληλογραφία
• έγγραφα
• σημειωματάρια
• βιβλία
• προσωπικά αντικείμενα
Με σκοπό τη διάσωση και την ανάδειξή του το Αρχείο εντάχθηκε στο επιχειρησιακό Πρόγραμμα «Ψηφιακή Σύγκλιση», «Ψηφιοποίηση και προβολή αρχείων του Μουσείου Καζαντζάκη και ανάπτυξη εκπαιδευτικών εφαρμογών» την περίοδο 2013-2016.
Στο πλαίσιο το έργου το Θεατρικό Αρχείο Γιώργου Ανεμογιάννη ψηφιοποιήθηκε και τεκμηριώθηκε. Ταυτόχρονα και με στόχο την ανάδειξη και αξιοποίησή του για εκπαιδευτικούς σκοπούς δημιουργήθηκαν εκπαιδευτικές εφαρμογές.
